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植物特異性WUSCHEL相關同源盒(WOX)轉錄因子家族是植物所特有的一類轉錄因子(Transcription Factors,TFS),是真核同源盒轉錄因子超家族(Homeobox,HB)的植物特異性亞分支,已有研究表明,WOX 家族成員在植物的關鍵發育過程中履行專門的功能,如胚胎模式、干細胞維持和器官形成。甘藍型油菜(Brassica napus L.)由白菜(AA,n=10)與甘藍(CC,n=9)通過自然種間雜交后雙二倍體分化的典型復合種,是全球第二大油料作物。我國西北地區氣候寒冷干燥,低溫和干旱常常造成甘藍型油菜植株生長遲緩、育性較低。
甘肅農業大學農學院、省部共建干旱生境作物學重點實驗室孫萬倉教授帶領研究團隊利用生物信息學方法對WOX基因家族成員、進化關系、基因結構、保守結構域、染色體分布、啟動子順式作用元件等進行分析,并初步分析了部分WOX基因在冷/旱脅迫下的表達響應模式。
甘藍型油菜(58)、擬南芥(15)、白菜(30)、甘藍(28)WOX基因家族系統發育樹。
甘藍型油菜WOX基因家族在各組織(左)和低溫處理下(右)的表達模式分析。其中::silicle 角果;root 根;seed 種子;stem apex 莖尖;stem 莖;pollen 花粉;sepal 萼片;petal花瓣;leaf 葉。圖片均由論文作者提供
孫萬倉團隊在甘藍型油菜中鑒定到58個WOX基因,數量高于目前已報道的物種成員,系統發育樹將58個WOX基因分為三大類和九個亞支,這與番茄、煙草、棉花中WOX基因的分類相同;數量上的優勢表明,WOX基因家族在進化過程中經歷了顯著擴展,蕓苔屬基因組經歷了古代多倍體事件;對WOX基因進行定量分析發現,在冷脅迫和干旱脅迫下基因表達量有顯著變化,表明BnWOX基因可能在油菜響應冷/旱脅迫的調控機制中發揮著重要作用。
上述相關研究結果發表在《西北農業學報》2023年8期上。
論文相關信息:https://doi.org/10.7606/j.issn.1004-1389.2023.08.004
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